实验室间质控是检查各个实验室是否存在系统误差，找出误差来源，提高监测水平。这一工作通常由某一系统的中心实验室、上级机关或权威单位负责。

实验室质量考核，由负责单位根据所要考核项目的具体情况，参考前面所述内容，制订具体实施方案。

考核方案的内容有：质量考核测定项目；质量考核分析方法；质量考核参加单位；质量考核统一程序；质量考核结果评定。

考核内容有:分析标准样品或统一样品；测定加标样品；测定空白平行样品，核查检测下限；测定标准系列,检查相关系数和计算回归方程，进行截距检验等。通过质量考核,最后由负责单位综合实验室的数据进行统计处理后作出。

评价予以公布。各实验室可以从中发现所存在问题并及时纠正。工作中标准样品或统一样品应逐级向下分发，一级标准由国家环境监测总站将国家计量总局确认的标准物质分发给各省、自治区直辖市的环境监测中心，作为环境监测质量保证的基准使用。